Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms