Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms