Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms