Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Q6P79568 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Q6P79568 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms