Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn4P58404 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Strn4P58404 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Strn4P58404 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Strn4P58404 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Strn4P58404 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Strn4P58404 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Strn4P58404 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Strn4P58404 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Strn4P58404 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Strn4P58404 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms