Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrp1P56183 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms