Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sh3bp1P55194 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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