Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms