Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb42P49222 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb42P49222 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms