Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms