Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms