Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtgfrP43117 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PtgfrP43117 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PtgfrP43117 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PtgfrP43117 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PtgfrP43117 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtgfrP43117 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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