Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms