Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa3P35173 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms