Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcdP28867 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms