Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb9P28076 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms