Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms