Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VimP20152 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VimP20152 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VimP20152 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VimP20152 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms