Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NelfeP19426 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NelfeP19426 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NelfeP19426 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NelfeP19426 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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