Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18532 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18532 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18532 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18532 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms