Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxb1P17919 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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