Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrphP15331 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrphP15331 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PrphP15331 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrphP15331 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrphP15331 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrphP15331 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrphP15331 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrphP15331 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrphP15331 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrphP15331 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms