Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp1P12032 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms