Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms