Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa5P09021 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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