Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa4P06798 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms