Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgamP05555 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms