Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms