Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms