Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3pxd2aO89032 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3pxd2aO89032 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms