Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CcnkO88874 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms