Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dll3O88516 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms