Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1bO55017 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms