Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ArxO35085 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArxO35085 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ArxO35085 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ArxO35085 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ArxO35085 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ArxO35085 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArxO35085 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms