Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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