Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8050L7N2E3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8050L7N2E3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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