Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms