Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5294J3QP53 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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