Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms