Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp616J3QN14 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms