Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms