Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp994J3QM38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Zfp994J3QM38 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Zfp994J3QM38 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp994J3QM38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp994J3QM38 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms