Protein–RNA interactions for Protein: J3QJU9

Gm21886, Predicted gene, 21886, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21886J3QJU9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21886J3QJU9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21886J3QJU9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21886J3QJU9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21886J3QJU9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21886J3QJU9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21886J3QJU9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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