Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms