Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms