Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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