Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8247F6VRJ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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