Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms