Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmod3E9QA62 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms