Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SafbD3YXK2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms